Malgré le succès de la lutte génétique, les contournements de résistance révèlent que les schémas de sélection pour la résistance ont sous-estimé la capacité du parasite à s’adapter à des hôtes résistants. Cette adaptation parasitaire correspond à une modification de la structure pathogènique des populations de pathogènes : adaptation du parasite à son hôte ou/et émergence d’un pathotype virulent préexistant. Deux pathosystèmes sont étudiés dans cette équipe : RYMV/ riz et X. campestris/coton.
L'étude de la durabilité des résistances du riz au RYMV se décline en quatre axes complémentaires :
- identification, distribution et caractérisation des pathotypes virulents,
- étude des mécanismes d'émergence des pathotypes virulents,
- analyse des interactions gènes de virulence x gènes de résistance
- connaissance détaillée de la diversité virale (thème transversal).
L'étude de la durabilité des résistances du coton à la bactériose se décline en 3 activités :
- échantillonnage du matériel végétal et constitution d’une collection de souches
- étude de la diversité pathogénique en relation avec les gènes R
- étude de la diversité génétique en relation avec les gènes R.
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